基于多窗口不同特征的蛋白质相互作用位点预测

王菲露; 宋杨

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基于多窗口不同特征的蛋白质相互作用位点预测

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识别蛋白质相互作用位点在蛋白质功能研究中发挥着重要作用.文章从蛋白质序列出发,提取相关特征——序列谱、序列谱+信息熵,分别形成多个滑动窗口,以此构造输入特征向量.采用"留一法"生成训练数据集和测试数据集,使用支持向量机构建6种分类器,预测测试集中的表面残基是否是蛋白质相互作用位点,得到了较好的结果,说明了实验方法的有效性和可行性.

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来源
《安徽大学学报：自然科学版》 |2010年第5期|64-68|共5页
作者
王菲露; 宋杨;
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作者单位

安徽建筑工业学院电子与信息工程学院;

中国科学院合肥智能机械研究所;

中国科学技术大学自动化系;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类信息处理（信息加工）;
关键词
蛋白质相互作用位点; 序列谱; 信息熵; 滑动窗口; 支持向量机;

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