人源P2Y12基因生物信息学分析

摘要

目的:采用生物信息学方法对人源P2Y12基因结构特征进行分析.方法:利用DNAstar、Prot-Param、SOPM A、SignalP 4.1、M EGA等5个生物信息学平台,研究人源P2Y12基因和蛋白序列,及其理化性质、二级结构、跨膜结构、信号肽、疏水性、磷酸化和羰基化位点及B细胞抗原表位,并且对其蛋白作用功能和亲缘性进行分析.结果:人P2Y12基因编码区长1029 bp,编码342个氨基酸.人P2Y12蛋白分子式为C1836 H2868 N450 O476 S18,分子量为39438.78 u,理化性质稳定,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,含7个跨膜结构,无信号肽,有33个磷酸化位点和2个N-糖基化位点,存在6个B细胞抗原表位.通过String数据库得到蛋白相关功能和通路,发现P2Y12蛋白在G蛋白偶联相关受体、cAMP信号调节、血小板活化等信号通路中发挥着重要作用,是血小板相关生物过程的重要部分.同源性分析和进化树显示黑猩猩和猕猴与人源P2Y12蛋白相似性最高.结论:利用生物信息学方法对人源P2Y12基因及其蛋白进行研究,为血栓、血小板出血性疾病8(BDPLT8)等疾病的研究和相关药物研发应用提供参考.