吉尔吉斯白桦BkWRKY1基因克隆与序列分析

摘要

从吉尔吉斯白桦转录组文库测序中获得白桦BkWRKY1转录因子的cDNA序列,该序列包含2 189个碱基.序列比对和同源性分析表明,该基因cDNA序列包含1 728 bp的开放阅读框,可编码575个氨基酸,5'非翻译区(UTR)为119 bp,3'非翻译区(UTR)为342bp.该基因属于WRKY transcription factor家族,含有2个WRKY结构域,蛋白分子量为62.483 kD,理论等电点为7.32,负电荷残基(Asp+ Glu)总数为62个,正电荷残基(Arg+ Lys)总数为62个.蛋白不含有信号肽,具有一定的亲水性,为亲水蛋白,无跨膜结构.同源性比较与进化树分析表明,吉尔吉斯白桦WRKY蛋白与大豆和蒺藜苜蓿的WRKY蛋白在进化上关系较近.该基因在0.6％ NaHCO3胁迫处理后表达量增加,为上调表达基因.