基于COI基因的鸽遗传多样性和品种鉴定研究

摘要

我国鸽(Columba livia)产量仅次于鸡(Gallus gallus)、鸭(Anas platyrhynchos)、鹅(Anser cygnoides orientalis),为名副其实的第四家禽.研究鸽遗传资源的遗传多样性和品种鉴定,对于品种的保护和开发利用有重要的意义.本研究对白羽王鸽、泰深鸽和银王鸽3个群体的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome C oxidase subunitⅠ,COI)基因全序列进行PCR扩增和测序.结果表明,鸽mtDNA COI基因全长为1551 bp,没有发现插入和缺失,编码517个氨基酸.共计检测到核苷酸变异位点7个,定义了6个单倍型,其中单倍型Hap1和Hap2为3个鸽品种共享,出现频率分别为26次和15次.总体单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别0.726、0.00098和1.518,其中银王鸽最高,白羽王鸽最低.系统发育分析发现,家鸽和原鸽可以分为A和B2个世系分支,中介网络图以Hap1为中心节点,呈星状发散分布,经历过群体扩张.上述结果揭示,鸽COI基因突变较少,相对较为保守,不太适合区分不同鸽品种,但可以作为遗传标记研究遗传多样性和起源.该研究结果提供了鸽遗传多样性和遗传结构信息,为以后相关研究提供了参考依据.