SON-PCR扩增抗禾谷孢囊线虫基因LRR区及序列分析

摘要

根据与抗禾谷孢囊线虫(Heterodera avenae)基因Cre3的NBS(nucleotide binding site)编码区高度同源的Rccn4序列设计3条3'端嵌套引物,采用SON-PCR(single oligonucleotide nested PCR)方法从含有源于易变山羊草(Aegilops varibilis)的抗禾谷孢囊线虫基因的小麦(Triticum aestivum)-易变山羊草染色体小片段易位系E-10中获得了长度为1264 bp的Rccn-L(GenBank登录号为DQ124933),它将Rccn4 3'端延伸了1209 bp,编码区长1026 bp,含一个不完整的开放阅读框,一个终止密码子,没有起始密码子和内含子结构.其编码一个342个氨基酸残基的蛋白质,含有NBS(nucleotide binding site)-LRR(1eucine-rich repeats)类抗性基因LRR区的保守模体,呈现XXLXXLXXL重复.首次将SON-PCR方法成功地运用到植物基因组学研究中,为植物基因克隆又提供一方法.