榨菜瘤状茎膨大相关基因orf451的克隆及其表达分析

摘要

为了更好地了解榨菜(Brassica juncea var.tumida)瘤状茎膨大的分子机制,以榨菜不同发育时期的瘤状茎为材料,分离到一个cDNA-AFLP差异片段,利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆了包含有该差异片段的基因的cDNA全长(命名为orf451,GenBank登录号:KM213220),并对其序列及编码的蛋白质进行分析.结果表明,orf451的cDNA全长1 512 bp,最大开放阅读框为1 356 bp,与编码多聚半乳糖醛酸酶/糖苷水解酶的基因有很高的相似性(90％),其编码的蛋白具备多聚半乳糖醛酸酶(果胶裂解酶)和糖苷水解酶的功能域.利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对orf451的时空表达进行分析,发现在榨菜瘤状茎形成初期orf451在表皮和外皮层表达量最高,推测orf451参与了榨菜瘤状茎膨大过程中表皮与外皮层多聚糖的水解.本研究为阐明瘤状茎生长发育调控机制提供理论依据.