瓦氏雅罗鱼Commd9基因的克隆及其在碱度胁迫下的表达分析

摘要

铜转运Murr1结构域(copper metabolism Murr1 domain,COMMD)蛋白家族在生物体中广泛存在,参与机体核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)活性调节、钠转运、铜代谢以及缺氧的适应性调节等生物学过程。为研究Commd9在碱度胁迫下的作用,本研究采用c DNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次对具有耐高碱特性的瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)Commd9基因cDNA全长进行了克隆,命名为LwCommd9基因(GenBank No.MT013199)。该序列全长为938 bp,5’和3’非编码区分别为5和339 bp,开放阅读框为594 bp,编码蛋白含197个氨基酸,预测分子量为21.79 kD,理论等电点为5.63。系统发育分析显示,瓦氏雅罗鱼COMMD9氨基酸序列与鲤科鱼类的相似性较高,其中与鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)相似性高达93.37%。qPCR发现,LwCommd9基因在各组织中均有分布,在肝和肾组织中表达量显著高于其他组织(P<0.05)。高碳酸盐碱度胁迫下,LwCommd9基因在碱水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著下调(P<0.01),而在淡水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著上调(P<0.01),在肾组织中也有相同变化趋势。综上所述,LwCommd9基因在瓦氏雅罗鱼高碱适应过程中可能起到了关键作用,这将为后续鱼类耐高碱机制研究提供参考。