济宁百日鸡pri-miR-458b基因多态性及其与产蛋性状的关联分析

摘要

miR-458b-5p介导Wnt/β-连环蛋白(β-catenin)信号通路来调节鸡(Gallus gallus)卵巢卵泡发育,从而影响家禽产蛋水平。pri-miR-458b的SNP影响miR-458b的加工过程。为探究pri-miR-458b基因多态性与产蛋性状的关系,本研究通过直接测序法检测了pri-miR-458b基因的SNP,并将检测到的SNP与济宁百日鸡的产蛋性状进行关联分析。结果表明,pri-miR-458b基因在鸡群中共检测出30个SNP,有10个位点与产蛋性状相关,其中的rs316393825、rs734005133、rs737338503、rs733344248、rs740622221和rs7337777096个位点连锁不平衡,其联合基因型对42~49周产蛋数和产蛋总数有显著影响;单倍型AGCGCG可使42~49周产蛋数增加3.29枚,产蛋总数增加8.08枚。相较于AGCGCG型的自由能,GGCGCG型的自由能降低了3.3 kcal/mol,而GTTAAA型的自由能升高了5.3 kcal/mol。GGCGCG型的二级结构稳定性最高,AGCGCG型次之,GTTAAA型最低。本研究可为济宁百日鸡产蛋性状辅助选择提供有利用价值的分子遗传标记。