苏云金芽孢杆菌kurstaki亚种几丁质内切酶基因的生物信息学分析

摘要

以苏云金芽孢杆菌库斯塔克亚种(Bacillus thuringiensis subsp kurstaki)基因组DNA为模板,利用1对特异性引物通过Touchdown PCR方法扩增了长为 2 576 bp的几丁质酶kchi基因序列(GenBank登录号:AY189740).生物信息学分析发现:该序列包含1个完整的开放阅读框,编码688个氨基酸,推测是分子量约为75 820.等电点pI=5.89的几丁质酶前体.序列和结构比较分析结果表明:Kchi属于几丁质内切酶,包括几丁质酶催化区、粘蛋白Ⅲ型同源区和几丁质结合区3个结构域,在N端还有1个分泌信号肽.除与Bt巴基斯坦亚种几丁质酶同源性较低(相似性为61.3%)外,与Bt其他亚种的同源性都较高(≥92.0%).