川中黑山羊 BMP2、BMP4基因 cDNA 克隆及生物信息学分析

摘要

参照GenBank已公布的绵羊BMP2基因序列与牛BMP4基因序列分别设计一对引物，以川中黑山羊卵巢总RNA为模板，采用RT-PCR技术扩增川中黑山羊BMP2基因和BMP4基因的cDNA序列并进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明，川中黑山羊BMP2基因编码区全长为1188 bp（ GenBank登录号为KF492982），BMP4基因编码区全长为1230 bp（ GenBank登录号为KF492983），分别编码395、409个氨基酸。川中黑山羊与绵羊、牛、猪、人、马、鼠、鸡BMP2基因编码区序列的同源性分别为99．7％、98．7％、92．0％、89．6％、91．4％、86．1％、78．9％；川中黑山羊与绵羊、牛、猪、人、马、鼠、鸡BMP4基因编码区序列的同源性分别为99．3％、99．1％、95．9％、95．2％、94．4％、92.0％、80．1％。用MEGA 4．0构建物种间分子系统进化树，结果显示，BMP2基因和BMP4基因的聚类反应基本一致，川中黑山羊首先与绵羊聚类，再分别与牛、猪、马、人和鼠聚类，最后与鸡聚类，这与动物分类学基本吻合。