五龙鹅MHC ClassⅠ基因克隆及同源建模研究

摘要

主要组织相容性复合体(MHC)与动物机体对外源性抗原的免疫应答之间存在关联.从GenBank/DDBJ/EMBL基因库中读取鸡、其他鸟类、爬行类和哺乳类的MHC ClassⅠ基因进行序列分析设计引物,使用LA-PCR法从五龙鹅的基因组中克隆了MHC ClassⅠ基因序列(DNA序列和mRNA序列GenBank登录号分别为: AM114925和AM114924),并分析其基因组结构.运用生物信息学技术对测序结果进行分析显示: 基因组DNA由8个外显子和7个内含子组成,与鸡基因序列同源率为60.8%～64.1%,与人的同源率为42.9%.分子进化树进一步揭示了五龙鹅与鸡、其他鸟类、爬行类、哺乳类以及人类的进化关系,同源建模分析发现该基因由氨基末端结构域和羧基末端结构域构成.