从细胞色素b基因全序列探讨大额牛的分子系统发生

摘要

大额牛是一种半野生半家养的珍稀牛种,有关其起源和系统地位一直存在争议.通过PCR扩增、测序等步骤共获得了11头大额牛细胞色素6(Cyt b)基因全序列(1 140 bp).应用分析软件,对大额牛11条Cyt b序列进行了分析,并结合GenBank中牛属动物6个近缘种的同源序列,以亚洲水牛(Bubalus bubalis)为外群,分别采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建了牛属动物分子系统发育树.序列分析结果表明,11条大额牛Cyt b序列1 140位点中,共发现95个变异位点(占分析位点总数的8.33%),定义了6种单倍型,表明大额牛群体的Cyt b基因遗传多态性比较丰富.构建的NJ和MP分子系统树均显示,大额牛研究群体明显分为3支,第1支与普通牛(Bos taurus)相聚,第2支与牛(Bos indicus)相聚,第3支与印度野牛(Bos gaurus)相聚.系统发育分析表明,大额牛很可能是印度野牛的家养型或驯化种,我国大额牛群体可能曾受到其他牛种血缘的入侵.