不同地理群体的鲇线粒体DNA ND1基因序列比较分析

摘要

为了对长江中上游主要支流鲇5个野生群体——雅砻江群体(YLJ)、岷江群体(MJ)、金沙江群体(CS)、乌江群体(WJ)、(氵舞)阳河群体(WYH)的遗传变异进行分析,对27个样品的ND1基因进行PCR扩增,并将PCR产物进行测序；用CLUSTALXv1.81软件对所得的27个ND1序列进行比对；通过Dna SP5.10软件、Tajima's D和Fst分析对所得的ND1序列进行比较分析,并构建分子系统树.结果表明:共检测出105个变异位点,8种单倍型.雅砻江、岷江、金沙江、乌江、(氵舞)阳河5个野生群体的单倍型多样性(H)分别为0.400、0.600、0.667、0.857、0.400,核苷酸多样性(π)分别为0.000 82、0.000 62、0.044 44、0.044 36、0.000 41.雅砻江、(氵舞)阳河2群体存在负向选择或种群扩张,其余群体符合中性进化模型,且有一些单倍型的分化,只有金沙江群体的遗传差异显著,群体间分子变异不显著.结论:雅砻江、岷江、金沙江、乌江群体之间的亲缘关系较近,(氵舞)阳河群体与其他群体间的亲缘关系较远.