首页> 中文期刊> 《福建农业学报》 >双孢蘑菇As2796子实体发育转录组测序分析

双孢蘑菇As2796子实体发育转录组测序分析

         

摘要

对双孢蘑菇As2796子实体发育4个不同阶段样品的转录组进行测序,并与双孢蘑菇参考基因组进行序列比对.共比对到9207个转录本,发掘新基因393个,其中164个得到功能注释.基于比对结果进行各基因在不同样品中的表达量分析,识别差异表达基因,发现原基期与其他3个不同发育时期有316个共同差异基因.对差异基因进行功能注释和富集分析,可为进一步研究双孢蘑菇子实体生长发育的相关基因奠定基础.%Samples of Agaricus bisporus As2796 fruiting bodies in 4 developmental stages were collected for transcriptome sequencing.After aligned with the reference genome sequence of the mushroom,9207 transcripts were identified.Among them,393 were new genes with 164 being functionally annotated.The expression level of the genes was analyzed to differentiate the samples.The alignments showed an overlapping of 316 differentially expressed genes between the primordium and the 3 other developmental stages.An analysis and function evaluation on these genes were performed for further study on the growth and development of A.bisporus fruiting body.

著录项

  • 来源
    《福建农业学报》 |2018年第3期|282-287|共6页
  • 作者单位

    福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心;

    福建福州 350014;

    福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心;

    福建福州 350014;

    福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心;

    福建福州 350014;

    福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心;

    福建福州 350014;

    福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心;

    福建福州 350014;

    福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心;

    福建福州 350014;

    福建省农业科学院食用菌研究所/特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心;

    福建福州 350014;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 S646.11;
  • 关键词

    双孢蘑菇; 子实体发育; 转录组测序;

相似文献

  • 中文文献
  • 外文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号