斑点叉尾鮰EGFL9基因变异位点与生长性状的关联分析

摘要

【目的】研究斑点叉尾鮰表皮生长因子样结构域蛋白EGFL9(Multiple epidermal growth factor-like domains protein 9)基因与其生长性状的相关性,为斑点叉尾鮰的分子标记辅助育种奠定基础。【方法】采用靶向基因测序技术对EGFL9基因进行测序,与参考基因组比对后筛选变异位点,并将获得的变异位点与生长性状进行关联分析。【结果】在EGFL9上共发现27个多态位点,经过滤,获得22个有效突变位点,其中4个变异位点(g.142、g.573、g.3079、g.7409)对斑点叉尾鮰的生长性状具有显著影响,位点g.142、g.3079、g.7409位于内含子中,位点g.573位于第2外显子上;g.142位点的A/A型个体的平均体长显著高于A/G型个体(P<0.05);g.7409位点A/G型个体的平均体长显著高于G/G型、A/A型个体(P<0.05);g.3079位点C/C型个体的平均体质量和体长均显著高于A/A型个体(P<0.05);位于外显子上的InDel位点g.573使EGFL9基因编码蛋白减少了一个苏氨酸残基,对蛋白质三级结构产生较为明显的影响,该位点TACC/T型个体的平均体质量显著高于TACC/TACC型个体(P<0.05),平均体长显著高于TACC/TACC型与T/T型个体(P<0.05)。【结论】获得的4个斑点叉尾鮰生长相关标记(g.142、g.573、g.3079、g.7409)与其生长性状显著关联,可以应用于后续斑点叉尾鮰育种芯片开发和分子标记辅助育种。