乙肝病毒(HBV)感染对肝细胞癌(HCC)患者A-to-I RNA编辑的影响

摘要

目的 探究乙肝病毒(hepatitis B virus,HBV)感染对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者肝脏正常组织和癌组织中腺嘌呤转变为次黄嘌呤(adenine to inosine,A-to-I) RNA编辑活性的影响.方法 从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)收集28套成对正常组织和癌组织的转录组数据,分为HBV阴性正常组织(HBV-N)组、HBV阴性癌组织(HBV-T)组、HBV阳性正常组织(HBV+ N)组和HBV阳性癌组织(HBV+ T)组.用SPRINT软件进行位点鉴定后,从催化酶表达水平、位点编辑水平和位点所在基因的基因本体论(gene ontology,GO)富集通路层面进行分析.结果 在正常组织和癌组织中均发现HBV感染时腺苷酸脱氨酶1 (adenosine deaminases acting on RNA 1,ADAR1)表达水平更高.癌组织中HBV阳性样本的A-to-I RNA编辑水平上升,正常组织中则无此现象.两类组织中HBV阳性样本编辑基因显著富集在细胞增殖、基因调控相关信号通路.结论 HBV感染上调ADAR1的表达,从而改变宿主编辑事件活性,这对HCC的发生发展可能有促进作用.