浙江省某农村地区猪粪便与胆汁中戊型肝炎病毒的检测和部分序列分析

摘要

目的调查浙江省某农村地区猪群中戊型肝炎病毒的感染状况,探讨猪戊型肝炎病毒与人戊型肝炎病毒的关系.方法应用逆转录-巢式聚合酶链法(RT-nPCR)对当地某养猪场的猪粪便标本和生猪屠宰中心的猪胆汁标本进行HEV RNA的检测,并对部分阳性标本进行克隆测序和序列分析.结果132份猪粪便标本中13份为HEV RNA阳性,阳性率为9.85%;160份猪胆汁标本中有11份为阳性,阳性率为6.88%.序列分析发现猪HEV相互之间在ORF2部分区域(nt6317～6466)的核苷酸序列的同源性为90.0%～100.0%,与当地人株核苷酸序列的同源性为88.7%～100.0%,与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型的同源性分别为78.7%～84.0%,80.0%～85.3%,76.0%～83.3%和84.7%～95.3%.结论该地区猪HEV与当地人HEV同属HEV Ⅳ型.