基于COI基因分析长江下游典型水域翘嘴鲌的遗传多样性

摘要

为了解长江下游典型水域翘嘴鲌(Culter alburnus Basilewsky)群体遗传多样性现状,利用线粒体COI基因序列对淀山湖(DSH)、太湖(TH)、长漾湖(CYH)和长江水域江苏段(CJ)的4个翘嘴鲌群体进行了遗传多样性分析.结果显示,在816 bp的COI基因序列中,碱基A、T、C和G的平均含量分别为26.3％、28.7％、26.8％和18.2％,表现出较明显的AT偏倚性;4个群体共检测到302个多态性位点,定义了43个单倍型;单倍型多样性指数(Hd)为0.639～0.912,表现为CJ>CYH>DSH>TH,核苷酸多样性指数(Pi)为0.0052～0.0874,表现为CJ>DSH>CYH>TH.群体间遗传分化系数Fst和遗传距离分析表明,TH群体与其它群体间均存在较高的遗传分化,且与其它群体间的遗传距离均较远.AMOVA分析结果表明,遗传变异主要来自群体内,群体间遗传分化未达到显著水平.中性检验结果显示DSH群体的Tajima′s D和FuLiF均为负值,表明DSH群体可能经历过群体爆发和扩张事件,可能与淀山湖的形成历史有关.研究表明,翘嘴鲌不同地理群体间的遗传分化程度不同,4个水域的翘嘴鲌群体遗传多样性均较丰富,每个群体都可单独作为一个保护单元,其中CJ群体的遗传多样性最高,表明长江江苏段翘嘴鲌种质资源状况较好.