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基于线粒体COI基因分析广州市15个白纹伊蚊种群的遗传多样性

         

摘要

目的 探讨广州市白纹伊蚊不同地理种群的遗传多样性、遗传分化和系统发育关系.方法 本实验于2020年9月至2020年11月期间,采集广州市11个行政区的共计15个白纹伊蚊种群.单只蚊虫提取基因组DNA,通过PCR法扩增COI基因序列并测序,获得的序列在GenBank上经过BLAST比对.BioEdit 7.2软件观察序列峰图.MEGA X软件对齐序列,分析碱基组成,构建系统发育树(NJ法).DNAsp 6.12软件分析位点多态性,单倍型及其多样性,进行错配分布分析.Ar-lequin 3.5软件进行分子变异分析、进行中性检验.DAMBE 7.2软件分析序列的系统发育信号.PopART 1.7软件构建单倍型网络图(Median joining法).结果 广州市15个白纹伊蚊种群共获得642条序列,其长度为603 bp.A碱基加T碱基平均含量是67.5%,符合线粒体DNA的AT偏向性.单倍型分析共检出45种单倍型,其中单倍型1为优势单倍型.中性检验表明广州市部分种群不符合中性理论,但大部分种群都经历过种群扩张,而错配分布却表明仅有少部分种群经历过种群扩张.Mantel检验表明15个白纹伊蚊种群不存在地理隔离现象.种群遗传分化显示各种群间交流较频繁,且种群间的遗传分化很低,差异更多来自于个体间.结论 广州市的白纹伊蚊种群间基因交流较频繁,遗传分化小,遗传多样性偏低.这可能使不同地理种群的白纹伊蚊具有相似的媒介能力.

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