玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因多态性与组织表达分析

摘要

以cDNA为模板进行PCR扩增和克隆分析,从7尾玻璃红鲤(Cyprinus carpio var.wananensis)的70个有效克隆中,获得长度为624 bp的MHC Ⅱ α/β不同编码序列25/31个,分属于7/10个不同等位基因,揭示玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因的多态性仍较丰富.其中Cyca-DXA17*01和Cyca-DAB1*1201、Cyca-DAB1*1301、Cyca-DAB3* 1901、Cyca-DAB3* 2001、Cyca-DAB3* 2101、Cyca-DAB3* 2201为新发现的7个基因.分析表明,α1/β1结构域的核苷酸/氨基酸变异位点数明显高于α2/β2结构域；α1、β1结构域抗原结合位点(PBR)的ω值(ω=dN/ds,5.209和1.703)都大于1,揭示玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因在进化过程中受到正向选择作用.半定量分析显示,玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因在肾和脾中有较强表达,中等程度表达于胃、肝和肠,而鳃、心和眼的表达较弱.