巨桉EXP基因家族的生物信息学分析

摘要

[目的]本研究有助于了解EXP基因家族的基本特征,为深入研究其功能搭建平台.[方法]本研究对从巨桉(Eucalyptus grandis Hill)中筛选出35个EXP基因家族成员(EgrEXP1～EgrEXP35),利用生物信息学方法对其基因特征与表达模式进行综合分析.[结果]巨桉EXP基因分布在8条染色体之上,EXP蛋白均定位在细胞质膜上发挥作用,大多数的家族成员具有信号肽.巨桉EXP编码的蛋白质由α-螺旋、延伸链、无规卷曲、β-转角组成.进化分析结果表明,巨桉EXP蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa)EXP蛋白的进化关系接近.35个巨桉EXP基因在巨桉未成熟木质部、成熟叶片、韧皮部、茎尖、木质部以及幼叶组织中表达模式存在显著差异.[结论] EXP基因家族各成员的表达模式不同,EgrEXP17、EgrEXP18可能在巨桉木材形成过程中起重要作用.