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巨桉SuSy基因家族的生物信息学分析

         

摘要

为了解EgrSuSy基因家族的生物学功能,从巨桉(Eucalyptus grandis)基因组数据库中筛选出18个SuSy基因家族成员(EgrSuSy1~EgrSuSy18),采用生物信息学方法对其基因特征与表达模式进行分析.结果表明,EgrSuSy基因分布在7条染色体上,EgrSuSy蛋白均定位在细胞质膜上,EgrSuSy家族成员均不具备信号肽.EgrSuSy蛋白质由 α-螺旋、延伸链、无规则卷曲、β-转角组成.EgrSuSy蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa)的SuSy蛋白亲缘关系相近.18个EgrSuSy基因在巨桉未成熟木质部、成熟叶片、韧皮部、茎尖、木质部以及幼叶组织中的表达模式不同.因此,EgrSuSy在巨桉不同组织和发育时期的功能可能存在差异.

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