基于生物信息学对二至丸治疗卵巢早衰的机制研究

摘要

目的:探讨二至丸治疗卵巢早衰的生物信息学作用及分子机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选二至丸的潜在活性化合物及靶点蛋白,在蛋白质数据库(Uniprot)中进行基因转换,借助人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、人类基因数据库(Gene Cards)检索与卵巢早衰相关的基因,导入Cytoscape 3.6.1软件构建“成分-基因-疾病”网络图,采用蛋白质相互作用数据库(String)构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用“Centi Scape 2.2”功能进行网络拓扑属性分析,筛选出核心靶点,最后进行基因本体论(GO)基因分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路富集分析。结果:共检索出二至丸17种潜在活性化合物和204个相应靶基因,以及4 591个卵巢早衰相关靶基因,通过Cytoscape 3.6.1软件进行网络构建,共获得13种与疾病相关的活性成分及154个靶点基因,结合蛋白质-蛋白质相互作用网络图,二至丸主要参与细胞自噬、细胞增殖、细胞凋亡、细胞代谢等生命过程,通过调控核因子-3(RELA)、丝裂原活化蛋白激酶1(Mitogen-activated Protein Kinase 1,MAPK1)、肿瘤蛋白P53(Tumor Protein P53,TP53)、转化生长因子-β1(Transforming Growth Factor-β1,TGF-β1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素-6(Interleukin 6,IL-6)、B细胞κ轻肽基因增强子核因子抑制因子α(NF-κB Inhibitor Alpha,NFKBIA)等靶点发挥治疗卵巢早衰的作用。结论:二至丸可多成分、多靶点、多途径发挥治疗卵巢早衰的作用,这为实验室及临床进一步探究药对治疗卵巢早衰的作用机制提供了一定依据。