基于TCGA数据库分析FOXO1在肝癌中的表达及预后意义

摘要

目的基于TCGA及HPA数据库探讨FOXO1在肝癌中的表达及预后相关性。方法下载TCGA数据库中肝癌RNA-seq数据,R软件分析FOXO1基因在肝癌和癌旁组织中的表达差异。临床相关性分析揭示其与肝癌临床病理特征的相关性。生存分析评价其表达水平与患者预后的关系;单、多因素Cox分析寻找预后因子。CIBERSORT评估其表达水平与肿瘤微环境中TIICs相关性。KEGG信号通路富集分析FOXO1在肝癌中的潜在功能。结果与癌旁组织比较,FOXO1在肝癌组织中低表达(P=1.321E-15)。生存分析表明FOXO1高表达组肝癌患者总体生存率高于低表达组(P<0.05);临床分期、T分期和M分期为预后因子,但FOXO1尚不能视为独立预后因子。在肝癌TME中,FOXO1表达水平与静息CD4记忆性T细胞和幼稚B细胞成正相关关系,而与活化的CD4记忆性T细胞和巨噬细胞M2成负相关关系。FOXO1参与多条肿瘤相关信号通路。结论FOXO1基因在肝癌中低表达,且其表达水平与肝癌患者总体预后有关。FOXO1可作为肝癌预后相关的生物标志物,有望成为肝癌诊断和治疗的靶点。