鸡肾型IBV山东分离株核蛋白基因的遗传变异分析

摘要

应用RT-PCR方法扩增到了山东省2006—2007年分离的10株肾型IBV核蛋白(N)基因片段,并将其进行了克隆、序列测定及分析。结果发现,10株肾型IBV分离株核蛋白基因均含有1个长1230bp的ORF,编码由409个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的插入和缺失。与GenBank中的20个IBV参考毒株核蛋白基因序列进行比较和分析,发现10株肾型IBV分离株主要分布于2个群中。第Ⅰ群与弱毒疫苗株H120和参考毒株D41、D1466的亲缘关系较近,第Ⅱ群与参考毒株LX4、GDS14的亲缘关系较近。对核蛋白基因及其局部功能区序列比较发现,山东分离株与H120疫苗株核蛋白相比存在广泛的氨基酸变异,以点突变为主,突变位点无明显规律性。