快速诊断性DNA测序法鉴定致病性猪链球菌

摘要

目的尝试将诊断性DNA测序方法优化后用于猪链球菌的快速鉴定。方法5个来源于临床感染病例的可疑猪链球菌分离株,用诊断性PCR产物直接测序法分析其基因组上的16SrRNA,cps2J和mrp3个特征性靶基因的DNA序列;并对整个技术流程进行优化改进,缩短获得结果的时间。结果获得了5个可疑猪链球菌菌株的3个靶基因片段的DNA碱基序列;这5个菌株被扩增检测的基因区域,有相同的16SrRNA、cps2J和mrp基因片段,长度分别为336、437、520bp;将这3个靶基因片段序列上载到NCBI-BLAST服务器,与GenBank核酸序列数据库的已知序列进行比对分析,结果显示,该5个可疑菌株的被分析的3个靶基因片段与猪链球菌2型的同源性最高。优化后的方法在得到经过适当培养的纯菌后,在不超过7～8h内,就可以获得靶基因片段的DNA测序结果。结论该5个来源于临床感染病例的可疑菌株为血清2型猪链球菌;经优化改进的诊断性DNA测序方法可用于猪链球菌的快速鉴定。