我国部分地区丙型肝炎病毒5′端部分基因序列的比较

摘要

目的 :测定我国部分地区丙型肝炎病毒 (HCV)分离株的 5′端部分cDNA序列 ,研究其基因型以及变异特点 ,为丙型肝炎的治疗和预后判断提供参考依据。方法 :用反转录套式聚合酶链反应 (RT -nPCR)法和 5′NCR区引物对我国部分地区 9株HCVRNA阳性血清进行扩增 ,扩增产物为 2 56bp ,将其纯化连接到PGEM -T载体上 ,然后进行测序 ,并与已发表的 50株HCV全序列的相应序列比较 ,并用种系发生法分析。结果 :该 9株HCV5′NCR核苷酸序列的同源性为93.0 %～ 99.6% ,其中 7株之间的同源性为 98.8%～ 99.6% ,另两株为 99.6%。同其它 50株同源性比较结果提示 ,7株属 1b型 ,2株属 2a型 ,种系发生法分析也支持这一结果。变异分析结果表明 ,同一亚型的核苷酸变异特点相似。结论 :该 9株HCV分离株分属 1b型和 2a型 ,该区同源性较高 ,但同一亚型的核苷酸变异特点相似。