LINKAGE软件在遗传流行病学两位点及多位点连锁分析中的应用

摘要

LINKAGE(5.10版)分析软件2年前由美国哥伦比亚大学的Jurgott写成,其在遗传流行病学连锁分析中的应用前景非常广阔。LINKAGE软件的核心由一套分析程序组成,其基于最大似然值的估计而计算重组率和Lods值,也可以进行遗传危险性分析。主要分析程序包括:(1)ILINK、CILINK:两位点连锁分析估计重组率、计算最大Lods值;前者适用二代家系,后者则适用于3代家系;另外ILINK还可以估计外显率、基因频率等参数;(2)MLINK:两位点连锁分析时二代或三代家系资料的Lods值计算画表及危险性分析;(3)LINKMAP与CMAP:多位点连锁分析通过似然值计算进行多个位点的定位程序,前者适用二代家系资料,