与猪肉色相关数量性状位点的Meta分析与整合定位

摘要

为提高数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)定位的准确性及肉色性状基因型选择,收集和整理了71个肉色相关QTL相关信息,通过构建整合图谱并进行Meta分析,使用数学模型优化猪肉色相关QTL。以美国肉畜研究中心(USDA-MARC2.0)公布的猪遗传连锁图谱为参考图谱,利用71个猪肉色相关QTL构建新的整合图谱,进一步对新图谱中的QTL簇进行Meta分析,定位"真实"QTL,缩短置信区间、减少定位误差。结果表明:71个猪肉色相关QTL在SSC3、SSC4、SSC5、SSC6、SSC7、SSC8和SSC17等染色体聚合成18个QTL簇,通过Meta分析,得到18个"真实"QTL(MQTL)"。真实"QTL的图距比较原始QTL的平均图距,均有不同程度的缩短,缩短比例为21.12%～93.91%。位于SSC4的MQTL4,原平均图距为16.43cM,经优化后图距缩短为1.00cM,缩短比例达93.91%,明显提高了QTL定位的精确度。