猪SOCS-3 cDNA序列克隆及在各组织中表达

摘要

根据大鼠细胞因子信号转导抑制因子(suppressorofcytokinesignaling,SOCS)-3设计并合成一对引物,从八眉猪皮下脂肪组织提取总mRNA,RT-PCR扩增获得猪SOCS-3cDNA;利用半定量(semi-quantitative,SQ)RT-PCR技术检测大白猪各组织中SOCS-3mRNA的表达量.扩增获得SOCS-3基因GenBank登陆号DQ644577,用CDD软件进行SOCS-3基因结构分析,该序列具有SOCS-3特有的保守结构域SH2和SOCS-box.用ClustalW软件进行同源性分析发现,猪SOCS-3基因与人、大鼠和小鼠的同源性分别为92%、88%和88%.SQRT-PCR组织表达检测表明SOCS-3基因在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、皮下脂肪和内脏脂肪中均有表达,其中肺脏和脾脏的表达丰度最高,肝脏和内脏脂肪中的表达量最低.