中华按蚊丝氨酸蛋白酶抑制因子14(SRPN14)基因的多态性和进化研究

摘要

目的 鉴定和定位中华按蚊丝氨酸蛋白酶抑制因子14（SRPN14）基因，分析其在不同群体中的多态性，以及进化中的选择压力。 方法 依据中华按蚊基因组测序数据，设计引物，建立扩增SRPN14基因部分片段的体系，荧光原位杂交进行染色体定位。测定采自我国12省（市）18个采集地的中华按蚊群体的SRPN14基因部分片段序列，计算其在群体内与群体间的遗传差异，以及适应性进化的选择压力。 结果 本研究获得的中华按蚊SRPN14基因部分序列长度为429 bp，与冈比亚按蚊SRPN14基因的对应位置在核苷酸和氨基酸水平的序列一致性分别为77%和88%，位于唾腺染色体的2L：23C亚区。采自我国13个群体411个个体中，SRPN14的等位基因数目共204个，其中51个在群体间共享，占25.00%。13个群体的中华按蚊SRPN14等位基因数目范围为11（辽宁群体LN）-33（重庆群体CQ），核苷酸多态性为0.008（LN）-0.024（海南群体HAN）。AMOVA分析结果显示，群体内变异显著大于群体间，群体内变异占总变异的95.79%，群体间差异小，遗传分化指数（FST）值为0.042。中华按蚊各群体SRPN14基因核苷酸同义替换位点数明显多于非同义替换位点数，ω均小于1。 结论 SRPN14基因在中华按蚊群体中存在一定的多态性，其进化受到负选择压力。