丙型肝炎病毒NS5A蛋白反式调节基因2不同剪切体调节靶基因的比较

摘要

目的:利用基因表达谱芯片技术筛选、比较丙型肝炎病毒NS5A反式调节基因2不同剪切体对HepG2细胞基因表达的调控作用及差异性.方法:利用分子生物学技术和生物信息学技术相结合,克隆人NS5ATP2的不同剪切体蛋白的编码基因,常规分子生物学技术构建相应的真核细胞表达载体pcDNA3.1-NS5ATP2(615)和pcDNA3.1-NS5ATP2(216).脂质体技术转染肝母细胞瘤细胞系HepG2利用基因表达谱芯片技术筛选转染细胞的差异表达cDNA的类型.结果:对于2个基因剪切体转染细胞系差异表达基因谱的分析,NS5ATP2(615)和NSSATP2(216)共同上调的基因43条;NS5ATP2(615)和NSSATP2(216)共同下调的基因13条;NS5ATP2(615)上调,而NS5ATP2(216)下调的基因类型3条;未发现NS5ATP2(615)下调;NS5ATP2(216)上调的基因类型;还有一些靶基因,或只受到NS5ATP2(615)的调节,或只受到NS5ATP2(216)的调节.结论:不同剪切体的作用之间有共同的靶基因,也有不同的靶基因,甚至对于同一基因有相反的调节功能.