大豆花叶病毒杭州分离物基因组全序列测定及其结构分析

摘要

测定了大豆花叶病毒杭州分离物(SMV-HZ)的基因组全序列.该病毒基因组全长9588个核苷酸,3'末端具poly(A)尾,包含单一开读框,编码一个350.07kD的多聚蛋白.基因组全序列与美国SMVG2、G7、N株系及我国黄淮5号株系(Y5)的核苷酸同一性分别为93%、93%、94%和96%.多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的10个成熟蛋白.SMV-HZ与G2、G7、N的不同成熟蛋白间的氨基酸同一性为89%～100%;SMV-HZ与Y5的不同成熟蛋白间氨基酸同一性则较高,达97%～100%.多重分析显示了SMV-HZ与G2、G7、N、Y5之间的序列差异,G2、G7的P1蛋白氨基酸序列明显不同于其他株系.对SMV-HZ与我国其他分离物也进行了序列比较,对CP蛋白氨基酸序列的系统进化树分析表明SMV-HZ与BJ分离物的亲缘性最高.