绞股蓝萜类合成酶(TPS)基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

摘要

为研究绞股蓝萜类合成酶(TPS)基因家族成员及其在非生物胁迫下的作用,采用生物信息学分析方法,在全基因组水平上对绞股蓝TPS基因家族进行鉴定和分析,并分析了这些家族成员在绞股蓝不同组织以及多种非生物胁迫下的表达模式。结果显示绞股蓝有24个TPS基因家族成员,其蛋白长度294~842 aa,均定位在细胞质或叶绿体中,并且不均匀地分布在绞股蓝11条染色体上。系统发育树结果表明绞股蓝TPS基因家族成员可分为5个亚家族。通过启动子顺式作用元件分析,预测到绞股蓝TPS基因家族成员能响应盐、低温和黑暗等多种非生物胁迫。通过分析绞股蓝不同组织的表达谱数据,发现绞股蓝有9个TPS基因的表达具有组织特异性。荧光定量PCR结果表明,GpTPS16、GpTPS17、GpTPS21能响应多种非生物胁迫。该研究对进一步探索绞股蓝TPS基因在非生物胁迫下的生物学功能具有重要指导意义。