脐橙SOC1基因的克隆及其在脐橙花发育过程中的表达分析

摘要

SOC1是控制开花的关键因子,对柑橘的花发育过程起重要作用。以赣南早脐橙为试材,提取成熟叶片总RNA合成cDNA,RT-PCR扩增脐橙CsSOC1a基因CDS全长,对其进行生物信息学分析和花发育不同阶段的表达模式分析。结果表明:脐橙CsSOC1a基因的CDS全长为663 bp,编码220个氨基酸,分子式为C_(1080)H_(1791)N_(331)O_(343)S_(9),分子量大小为25.19 kD,为亲水碱性蛋白;CsSOC1a编码的蛋白质含有MADS-box、K-box和SOC1-motif保守结构域,属于MADS超家族的SOC1/T3亚家族;进化树聚集成3个簇,脐橙SOC1a基因和其他柑橘SOC1基因聚在第2簇。顺势作用元件分析表明CsSOC1a含有光响应元件、植物激素响应元件、低温应答元件等调控元件。相对表达分析发现CsSOC1a主要积累在赣南早脐橙的成熟叶片中,在脐橙开花前和低温处理条件下CsSOC1a相对表达量均显著上调。这些结果表明CsSOC1a基因能够响应低温信号,对赣南早脐橙的成花诱导起促进作用。