西藏高原放牧藏猪结肠微生物的特异性研究

摘要

试验通过高通量测序技术,测定放牧藏猪、舍饲藏猪与瘦肉型猪（杜×长×大,DLY猪）结肠微生物16S rRNA V3-V4区域的基因序列,比较分析西藏高原3个类型猪结肠微生物的组成及多样性。结果显示,放牧藏猪和舍饲藏猪结肠微生物分类操作单元（OTU）总数、辛普森指数、Chao1指数、ACE指数及香农指数显著高于DLY猪（P＜0.05）,放牧藏猪与舍饲藏猪无显著差异（P＞0.05）。3个类型猪结肠微生物共划分为14个门,59个属。厚壁菌门在所有猪中相对丰度均最高,放牧藏猪放线菌门相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪（P＜0.05）,舍饲藏猪拟杆菌门相对丰度显著高于放牧藏猪与DLY猪（P＜0.05）。放牧藏猪双歧杆菌属、Dehalobacterium、萨特氏菌属、YRC22的相对丰度显著高于舍饲藏猪与DLY猪（P＜0.05）,舍饲藏猪瘤胃球菌属、Sphaerochaeta、Paludibacter相对丰度最高（P＜0.05）。结果表明,放牧藏猪结肠中含有较多与纤维降解和抗病力有关的菌群。