特应性皮炎局部皮损发生的关键基因筛选

摘要

目的 筛选特应性皮炎（AD）局部皮损发生的关键基因及预测潜在的治疗药物。方法 从GEO数据库中获得GSE153007基因芯片数据，运用R语言进行数据矫正、差异表达基因的筛选、GO功能富集和KEGG通路富集分析，并通过STRING在线数据库进行蛋白互作分析，用Cytoscape软件中的插件MCODE进行子网络模块分析，筛选出特应性皮炎局部皮损发生的关键基因，最后利用Connectivity Map预测减轻特应性皮炎局部皮损的潜在小分子化合物。结果 本研究共筛选出100个差异表达基因和8个关键基因LCE3A、LCE3D、PI3、SPRR1A、SPRR1B、SPRR2D、SPRR2G和SPRR2E。GO分析共富集164个功能，包括抗菌体液反应、分泌颗粒腔、RAGE受体结合等；KEGG分析共富集6个通路，差异表达基因与IL-17信号通路最相关。预测出奥利司他、多沙唑嗪、PU-H71、AZD-7762、TUL-XXI039和RS-504393小分子化合物可作为减轻特应性皮炎局部皮损的潜在药物。结论 LCE3A、LCE3D、PI3、SPRR1A、SPRR1B、SPRR2D、SPRR2G和SPRR2E可能是特应性皮炎局部皮损发生、发展相关的关键基因，预测的6个小分子化合物可为后续药物研究提供理论参考。