一起GⅠ、GⅡ型诺如病毒混合感染疫情的病原鉴定及基因特征分析

摘要

目的对2018年湖州一起赴泰国旅游团游客中发生的急性胃肠炎疫情进行诺如病毒核酸检测及基因分型。方法采用real-time RT-PCR方法对送检的疫情标本进行GⅠ和GⅡ型诺如病毒核酸检测。采用RT-PCR方法对阳性标本进行RdRp区和VP1区部分片段的扩增和测序。综合系统进化分析和重组分析结果判定病毒基因型别。结果送检的8例病例的粪便标本均为诺如病毒核酸阳性。其中5份标本为GⅠ、GⅡ诺如病毒核酸同时阳性,3份标本为GⅡ诺如病毒核酸阳性。8份阳性标本有5份测序成功。系统进化分析结果显示本次疫情检出的GⅡ型诺如病毒为GⅡ.P17-GⅡ.17基因型,GI型诺如病毒为GⅠ.P4-GⅠ.5重组株。结论该起赴泰国旅游团游客中发生的急性胃肠炎疫情是由GⅡ.P17-GⅡ.17和GⅠ.P4-GⅠ.5基因型诺如病毒混合感染所致,推测感染来源来自泰国曼谷旅行期间。