河南省2008～2009年麻疹野病毒核蛋白基因特征分析

摘要

目的了解河南省流行的麻疹野病毒的基因特征,为制定消除麻疹策略提供依据。方法用非洲绿猴肾细胞/淋巴信号激活因子转染的非洲绿猴肾细胞[Vero Cell/Signaling Lymphocyte Activation Molecule(Vero/SLAM)]从疑似麻疹病例标本中分离麻疹野病毒,用逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase ChainReaction,RT-PCR)扩增麻疹野病毒分离株的核蛋白(Nucleoprotein,N)基因羧基末端676个核苷酸片段,再对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析。以N基因羧基末端450个核苷酸片段构建基因亲缘性关系树,进行核苷酸变异分析。结果河南省2008～2009年共分离麻疹病毒147株,挑选其中73株测序后均为H1基因型,73株麻疹野病毒450个核苷酸的平均进化距离为0.020。2008年分离株与参考毒株的平均进化距离为0.055,其中与Hunan.China93-7/H1基因型的进化距离为0.012～0.026;2009年分离株与参考毒株的平均进化距离为0.067,其中与H1基因型的进化距离为0.013～0.020。结论河南省2008～2009年麻疹野病毒流行优势株为H1基因型,未发现病毒有较大变异,但存在一定的进化距离,呈现多个传播链的流行。