辽宁省2008年-2009年肠道病毒71型VP1区基因特征分析

摘要

目的:分析辽宁省手足口病(Hand-Foot-Mouth Disease,HFMD)肠道病毒71型分离株(Enterovirus 71,EV71)的分子特征。方法:从2008年和2009年手足口患者标本中分离EV71病毒,随机挑取18株分离株经RT-PCR扩增VP1区,并进行核苷酸序列分析。结果:18株EV71与C4亚型代表株具有较高的核苷酸序列同源性,在系统进化树上,其与C4亚型代表株处于同一分支,属于C4基因亚型。结论:2008年和2009年辽宁省HFMD的主要流行株为EV71 C4亚型,在进化树中形成紧密相连的二簇,处于不同的进化链中,提示辽宁省可能存在多个传播链。