华南地区猪圆环病毒3型感染的分子流行病学调查与分析

摘要

为了解猪圆环病毒3型（porcine circovirus 3,PCV3）在我国华南地区的感染情况,从2016年12月到2017年12月期间,从广东、广西、海南、福建、江西和湖南的177家规模化猪场采集1 078份病料,利用PCR技术检测PCV3的流行情况,并对PCV3阳性病料进行全基因组测序分析。结果显示：样品阳性率为29.04%（313/1 078）,猪场阳性率为44.63%（79/177）;从病料中测得的10株PCV3毒株全基因组核苷酸序列相似性为98.8%-100%,与国内外其他毒株的同源性在98.2%-100%之间;全基因组遗传进化分析显示PCV3遗传进化可以分为PCV3a和PCV3b,其中毒株CHN/HUNAN、CHN/GD-SH和CHN/GD-ZQ属于以美国毒株US/MO2016为代表的PCV3a分支,其余7个毒株属于PCV3b分支。结果表明：PCV3广泛存在于华南地区的猪群中,其基因组在不断进化,对PCV3的流行与致病机理有待进一步研究。