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东莞市2008年麻疹病毒基因型分析

         

摘要

目的:为了掌握东莞市2008年流行的麻疹病毒的基因型别和核蛋白基因变异情况。方法:采集东莞市2008年麻疹疫情中病人的血清、咽拭子、尿液等标本。对血清IgM抗体检测阳性的标本进行病毒分离,采用VERO-SLAM细胞进行培养,对分离到的病毒株提取核糖核酸(RNA),通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增麻疹病毒N基因序列,对扩增产物进行测序,取病毒株碳末端450bp核苷酸序列进行分析。结果:共分离到11株麻疹病毒株,均属于H1基因型H1 a亚型。11株毒株间的核苷酸同源性为98%~100%,氨基酸同源性为96.7%~100%,11株毒株间,2、4、5、7、8号的序列相同,9、10、11号的序列相同。各毒株与Ch ina93-2毒株同源性最高,为98.7%~99.3%,与Ch ina94-7毒株同源性为96.7%~97.3%,与其它H1亚型的同源性则为97.1%~98.2%。结论:东莞市2008年麻疹病毒流行株均属于H1基因型H1 a亚型,与中国其它地区的流行情况一致。暂无新型及传入性的其它亚型出现。

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