吉林省2009年-2016年肠道病毒71型VP1编码区基因特征分析

摘要

目的为了解吉林省2009年-2016年肠道病毒71型(EV71)流行株的基因特征。方法对吉林省2009年-2016年手足口病来源的EV71流行株进行VP1编码区逆转录PCR反应(RT-PCR)扩增,并对扩增产物进行核苷酸序列测定,使用Mega 6.0和Bioedit 7.01软件对扩增序列进行基因亲缘关系和氨基酸位点变异分析。结果吉林省2009年-2016年的97株EV71流行株与C4a基因亚型参考株位于同一簇支上,均为C4a基因亚型;97株EV71流行株在VP1编码区共有25处氨基酸位点变异,其中流行株突变数量较多的位点为22氨基酸位点和289氨基酸位点。结论吉林省2009年-2016年的97株EV71流行株均为C4a基因亚型,而且发生了多位点的氨基酸变异。