海南文昌鸡生长激素基因克隆测序及生物信息学分析

摘要

为了克隆文昌鸡的生长激素（growth hormone,GH）基因,获得该基因序列并分析基因结构和相关遗传变异,采用PCR方法扩增GH基因组序列,通过克隆测序寻找基因中的突变位点,利用PCR产物直接测序检测GH基因的多态性。结果显示：在鸡GH基因组中共发现7处碱基突变位点,分别位于GH基因的5＇端、第1内含子、第4外显子和第4内含子中;多态性分析发现,在GH基因-391 bp处的A/G突变位点、-360bp处的A/G突变位点、-121 bp处的C/T突变位点上,文昌鸡的优势基因型分别是AA、GG和CC;鸡GH基因启动子区域发现多种潜在的转录因子结合位点,如GATA序列结合因子1（GATA-binding factor 1,GATA-1）、环磷酸腺苷应答元件结合蛋白（c AMP response element-binding protein,CREB）、核因子1（nuclear factor 1,NF-1）、上游刺激因子（upstream stimulatory factor,USF）、增强子结合蛋白α（CCAAT/enhancer binding protein alpha,C/EBPalp）等。本试验为进一步研究文昌鸡GH基因的功能提供了参考。