林麝生长激素基因的克隆与生物信息学分析

摘要

了解林麝生长激素(GH)基因序列结构特点,为进一步研究GH基因的结构功能遗传变异规律及其与生长性能的关系提供科学依据.根据GenBank上已公布的绵羊全基因组GH基因序列设计合成4对特异性引物,以林麝基因组DNA为模板进行PCR扩增,将所获得的序列拼接,获得林麝GH基因CDS区序列,采用ExPASy等分子生物学工具对林麝GH蛋白的理化性质、二级结构、蛋白功能等进行预测.结果表明,林麝GH基因CDS区全长657 bp(GenBank登录序列号为KU296865),编码218个氨基酸.α-螺旋结构和卷曲结构构成了林麝GH蛋白二级结构的骨架,为跨膜蛋白,同时第1～26位氨基酸为信号肽,第27～218位氨基酸残基为生长激素结构域.进化分析结果表明,林麝与羊的关系最为接近,在分子水平上符合物种进化理论.本研究成功克隆了林麝GH基因CDS区序列,其序列保守性强,为下一步林麝GH基因的表达调控、进化和多态性分析奠定了基础.