银杏扩展蛋白基因的鉴定与特征分析

摘要

扩展蛋白是植物细胞壁重要的组成部分,在植物生长发育和逆境抗性等方面发挥着重要的作用。为探讨银杏(Ginkgo biloba)中扩展蛋白基因家族的组成和特征,本研究利用扩展蛋白的保守结构域,从银杏基因组中鉴定了28个扩展蛋白基因,包括20个EXPA基因、1个EXPB基因、4个EXLA基因和3个EXLB基因。银杏扩展蛋白基因的编码区长度在684~837 bp之间,编码227~278个氨基酸的蛋白质,具有保守的功能域、基序和氨基酸。不同亚家族基因在序列一致性、保守基序及内含子-外显子结构组成上有所不同,呈现亚家族特征。密码子分析显示,扩展蛋白基因具有密码子使用偏性,包含8个高频密码子。银杏扩展蛋白基因信息将有助于理解其在银杏基因组中的地位和作用,为深入研究功能提供基础。