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青稞HD-ZipⅣ 5基因克隆及表达探究

         

摘要

同源异型域-亮氨酸拉链(homeodomain-leucine zipper, HD-Zip)蛋白是高等植物特有的转录因子,在植物的生长、发育和抗逆适应中发挥重要的调控作用。本研究通过RT-PCR技术,从青稞(肚里黄品种)中克隆了HD-ZipⅣ5基因的CDS序列,进行生物信息学分析,并以大麦(Morex)为对照,利用荧光定量PCR(qPCR)比较分析了HD-ZipⅣ5在青稞不同组织和不同胁迫条件下的表达模式。结果表明,青稞HD-ZipⅣ5基因的CDS序列(2 388 bp)编码了796个氨基酸,与大麦HD-ZipⅣ5基因序列相比存在8个SNP变异,生物信息学分析显示该蛋白分子质量为85 679.38 Da,等电点为6.08,具有亲水性。qPCR结果显示青稞各组织中HD-ZipⅣ5在叶片中表达量最高,与大麦的组织表达模式一致;冷、盐及干旱胁迫下,青稞幼苗叶片HD-ZipⅣ5受盐胁迫诱导强烈表达,根HD-ZipⅣ5对干旱胁迫显著响应,与大麦中表达模式存在差异。本研究为HD-ZipⅣ5可能在青稞的叶片生长发育及抗逆适应中的作用提供科学依据。

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