NEDD4L作为骨肉瘤预后标志物的生物信息学研究

摘要

目的通过生物信息学方法筛查骨肉瘤(OS)患者与健康人骨组织的差异表达基因(DEGs)并进行筛选,构建OS患者的预后预测模型,为OS的预后评估提供潜在的生物标志物。方法基于公共数据库获得OS的DEGs,构建单因素及多因素Cox回归分析预后模型,绘制生存曲线并使用ROC曲线评估预后模型效果,使用蛋白质印迹和组化染色在蛋白水平检测表达格局。结果本研究在OS患者与健康人骨组织中共筛选出2806个DEGs;单因素Cox回归分析显示,其中9个基因是总生存时间的独立危险因素(P<0.05);以神经前体细胞表达发育下调样基因4(NEDD 4 L)为主的多因素Cox回归分析ROC曲线1、3、5年AUC分别为0.76、0.84、0.86,单因素Cox回归分析AUC分别为0.78、0.72、0.72;在肿瘤微环境分析中NEDD 4 L表达量与肿瘤纯度显著正相关(R=0.35,P=0.0010),在基因集富集分析中低表达NEDD 4 L与多种肿瘤相关通路有关;蛋白质印迹和组化染色均提示NEDD4L在OS中低表达。结论低表达NEDD 4 L与OS的不良预后存在紧密联系,构建了稳定的NEDD 4 L单因素与多因素预后预测模型,可为临床OS患者的预后评估提供参考。