16个鱼腥草基因型遗传多样性的SRAP分析

摘要

2009年以16个鱼腥草为材料,通过正交设计研究了鱼腥草的SRAP-PCR反应体系和扩增体系,并运用SRAP标记技术构建了16个鱼腥草材料的SRAP-PCR图谱,同时应用DPS分析软件构建了UPGMA聚类图.结果表明:(1)最佳反应体系为总体积25 μL中含40 ng DNA,0.1 mmol/L dNTPs,2.0 mmol/L Mg2+,37.5 ng/μL引物和2 U Taq酶.(2)从360对引物中筛选出条带清晰多态性好的118对,共扩增出7 582个条带,其中多态性条带6 590个,多态率为86.92%.(3)ZY06-028在Me9-GA18扩增产物的250 bp处有特异性缺失带,而ZY06-016 和ZY06-028在550 bp处有特异性缺失带;在Me8-Em10的扩增产物中ZY06-42和ZY06-01分别在300 bp和450 bp处出现特异性的带,这些带可用来鉴定不同的鱼腥草基因型.(4)在遗传距离0.31处,可将16个鱼腥草基因型分为3个类群,其中ZY06-024和ZY06-01鱼腥草与其它基因型显著不同,分别单独聚为一类,其余的聚为一类.