基于序列模式特征和SVM的剪切位点预测

摘要

通过对HS3D数据集供点序列碱基的统计分析,利用供体位点邻域碱基出现规律构造模式(motif)作为DNA序列的属性.设置序列属性值将字符序列映射成数字向量,应用支撑向量机进行实验,实现对供体位点的预测分类.实验结果表明,与改进的motif得分模型方法相比,该文方法可有效去除数据中异常数据对分类的影响,将DNA字符序列变换到motif属性数字序列空间具有有效性和实用性.